巧用细菌抗癌：2篇高分文聚焦肠球菌和工程菌

从06月07日0755到79000，我们阅读了9篇文章，重点关注：肺炎肠球菌、工程益生菌、FMT、纳米药物、结直肠癌转移、CMS分类、癌症恶病质、结直肠癌起始和微生物诊断。

瑞士肠球菌细胞死亡和分化的多种抗肿瘤机制——【10.717】瑞士肠球菌引起胸腺细胞异常迁移，

并触发全身性和肿瘤诱导的效应记忆T细胞反应，产生IFN并表达CD137嗜血肠球菌激活肠上皮细胞自噬机制，介导ATG4B依赖性抗癌作用。

这可能是因为它可以增加多胺的局部输送；海沃德肠球菌以双歧杆菌丰富宿主菌群；与活细菌相反，

巴氏杀菌的瑞士肠球菌细胞或膜囊泡没有抗癌特性；瑞士肠球菌、CD137激动剂抗体、亚精胺或动物双歧杆菌联合使用可达到最佳免疫治疗效果。【编辑点评】

肠道菌群的失衡可以预测癌症对免疫治疗的耐药性，在许多肿瘤模型中，平海肠球菌的定植可以弥补癌症相关的失衡。例如，在用抗生素治疗的小鼠中，肠球菌可以恢复环磷酰胺的抗肿瘤作用。

但机制未知。《细胞死亡与分化》近日发表的文章发现，瑞士肠球菌活菌可以调节免疫、代谢、肠道上皮和肠道菌群，促进抗肿瘤作用。

或可用于避免目前肿瘤治疗的耐药性。（@爱的选择）【原留言】

Multifaceted modes of action of the anticancer probiotic Enterococcus hirae

2021-05-11, doi: 10.1038/s414-021-00753-8

工程益生菌：用于肠癌的药物递送调节肠道菌群microbiome ——【11.607】构建基于戊糖片球菌菌株的工程益生菌，使其携带与分泌信号肽融合的治疗蛋白P8的编码基因，形成细菌药物递送系统。

用于治疗结肠直肠癌；在小鼠大肠癌异种移植模型中，该菌株显著缩小肿瘤体积，抑制肿瘤生长；口服细菌后，

AOM/DSS诱导的结肠炎相关CRC小鼠显示息肉消退和菌群多样性恢复。细菌能调节肠道菌群，

缓解化学诱导的菌群失调；与菌群平衡或失衡潜在相关的特定菌群（如Akk或Turicibacter）与其他菌群成员正相关或负相关。【编辑点评】

细菌可以用来运输抗癌药物，但使用减毒的致病菌会有毒性或感染的风险。乳酸菌安全、可食用且通常有益于健康，是运输抗癌药物活载体的理想选择。微生物组最近发表了一篇基于乳酸杆菌——、戊糖片球菌，

开发了P8治疗蛋白的工程益生菌给药系统，可抑制小鼠模型结直肠癌，促进肠道菌群平衡。（@爱的选择）【原留言】

A synthetic probiotic engineered for colorectal cancer therapy modulates gut microbiota

2021-05-26, doi: 10.16/s40168-021-01071-4

Nature子刊：自体粪菌移植恢复AML患者肠道菌群多样性Nature communication s ——【12.121】一项多中心单臂II期临床试验，

25名急性髓系白血病（AML）患者接受了强化化疗和抗生素治疗，接受了粪便细菌自体移植（AFMT）。高强度化疗导致菌群多样性指数显著降低，并伴有肠道菌群失调，微生物群落发生显著变化。

主要是促炎菌家族；AFMT后，多样性指数恢复到初始平均水平，相似性指数反映患者体内微生物群落的恢复情况，检测结果达到预先指定的终点；治疗过程中未出现严重副作用。

特别是没有感染相关的并发症。【编辑点评】

急性髓系白血病（AML）合并高强度化疗和广谱抗生素导致肠道菌群失调，促进病理状态并增加并发症的发生率。《自然通讯》最近发表的一篇文章，

本文报道了一项自体粪菌移植（AFMT）治疗急性髓系白血病患者（接受化疗和抗生素治疗）的多中心、单组II期临床试验。AFMT可以恢复患者紊乱的肠道菌群，表明对于接受高强度化疗和抗生素治疗的AML患者，

AFMT恢复患者肠道菌群是安全有效的。菌群丰富度和多样性系数等指标表明，AFMT能很好地重建患者肠道菌群。（@爱的选择）【原留言】

Gut microbiota persity after autologous fecal microbiota transfer in acute myeloid leukemia patients

2021-05-25, doi: 10.1038/s41467-021-23376-6

中山三院：多功能纳米药物高效治疗结肠癌Advanced science ——【15.84】脂质体包裹PI3K抑制剂IPI-549和光敏剂Ce6形成纳米药物LIC； LIC进入结肠癌细胞CT26，

理想的肿瘤治疗方法是消除原发肿瘤并激发宿主的抗肿瘤免疫反应，以防止肿瘤复发和转移。中山大学附属第三医院的韦伯和帅陶昕在《先进科学》杂志上联合发表了一篇文章。

脂质体包裹PI3K抑制剂IPI-549和光敏剂Ce6形成纳米药物LIC，介导光疗和MDSC靶向免疫治疗的协同作用，并通过光疗诱导肿瘤细胞的免疫原性死亡。

然而，MDSC靶向免疫疗法可以降低MDSC对T细胞的免疫抑制，调节免疫微环境并显著抑制肿瘤生长。同时，增加脾脏效应记忆T细胞可能会形成良好的免疫记忆，以防止肿瘤复发和转移。（@爱的选择）【原留言】

Multifunctional Nanodrug Mediates Synergistic Photodynamic Therapy and MDSCs-Targeting Immunotherapy of Colon Cancer

2021-05-21, doi: 10.1002/advs.202100712

转移性病灶对治疗的反应是不均匀的；约60%的患者至少有一处病变的反应与肿瘤整体大小相反；病变间较高的异质性与患者较短的无进展生存期和总生存期有关；靶向治疗联合标准化疗可降低病灶间的异质性，

在RECIST标准指南中，病灶总数通常用于评估患者对治疗的客观反应，但这种评估忽略了转移性肿瘤对治疗反应的异质性。癌症研究最近发表的一篇文章，

对2802例结直肠癌患者的11404个转移灶的分析表明，转移灶对治疗的反应性存在差异。而且，转移性肿瘤对治疗反应的时空异质性决定了药物的治疗效果和患者的生存率。

它可用于改进当前的治疗评估方法和患者预后。（@爱的选择）【原留言】

Spatiotemporal Heterogeneity Across Metastases and Organ-Specific Response Informs Drug Efficacy and Patient Survival in Colorectal Cancer

2021-02-15, doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3665

哈尔滨医科大学：基因调控因子或有助于结直肠癌分类生物信息学简报——【8.99】在具有一致分子亚型（CMS）的结直肠癌中，

共鉴定出235个功能基因调控因子（FGR）。 FGR表现出显著的组织学变化，影响细胞系的生长并富含肿瘤驱动基因和途径；在不同的CMS亚型中，同一FGR具有不同的功能，

例如，CMS1的抗肿瘤免疫途径主要由FGR激活（如STAT1和CREBBP），而CMS2-4的抗肿瘤途径受到抑制。 FGR介导免疫细胞受体结合配体的异常表达，

调节CMS亚型的肿瘤微环境；FGR的表达特征形成了一个较好的CMS分类标准，同时避免了样本成分的影响。【编辑点评】

常见分子亚型CMS是影响结直肠癌预后和治疗的重要因素，染色质调节因子、RNA结合蛋白和转录因子等基因调节因子是肿瘤特性的重要调节因子。

这两者之间有联系吗？哈尔滨医科大学的李霞和赵文远在《生物信息学简报》上联合发表了一篇文章。

整合和分析了一致分子亚型结直肠癌（CMS）的基因组、表观遗传组、转录组和相互作用网络，鉴定了主要功能基因调控因子（FGR），发现FGR可以调控CMS的核心致瘤过程/途径。而且，

FGRs的表达特征是优化的CMS分类器，与金标准分类器的一致性为88%，同时避免了样品组成的影响。（@爱的选择）【原留言】

Multilevel prioritization of gene regulators associated with consensus molecular subtypes of colorectal cancer

2021-04-19, doi: 10.1093/bib/bbab077

恶病质、肌少症和小鼠杂志——【9.802】在癌症恶病质小鼠模型（C26）中葡萄糖的代谢途径发生了改变。

氨基酸主要用于肝脏合成APR蛋白，而不是为三羧酸循环和糖异生提供燃料。肝脏肉碱水平下降35%，磷脂酰胆碱通路激活低下或肝脏脂肪变性的潜在原因；C26模型中乙酸和丁酸含量降低，

芳香族氨基酸代谢产物的减少或肠道菌群的改变，瘤胃成员是导致丁酸盐减少的主要细菌；肠道运输的双重加速是影响C26模型肠道微生物组成和活性的关键因素，导致粪便中蛋白质和氨基酸的损失。【编辑点评】

《恶病质、肌少症和肌肉杂志》最近发表了一篇结合质子核磁共振（1H-NMR）代谢组学和16S rDNA测序分析癌症恶病质小鼠的文章。

揭示了小鼠肝脏和肠道中可能与癌症恶病质有关的代谢途径，并讨论了恶病质对肠道菌群组成、活性和肠道转运的影响。（@爱的选择）【原留言】

Multichambered metabonomics and metagenomics revealed the main liver and intestinal disorders in cancer cachexia mice.

2021-02-17, doi: 10.1002/jcsm.12684

结直肠癌是如何开始的？胃肠病学——【17.373】X连锁基因缺失可用于量化人类结肠干细胞的动态，并分析KDM6A阴性克隆。

研究发现，KDM6A的丢失导致了隐窝中干细胞的竞争优势。 KDM6A阴性克隆扩增5倍，使隐窝分裂增加，但隐窝融合不增加，隐窝融合和分裂独立调节；即使在相对较新的克隆扩展中，

隐窝也能避免过度拥挤，从而在很大程度上达到环境密度； 隐窝扩散容纳新的隐窝，发生于整个生命周期。 定义出扩散不能容纳新隐窝的临界裂变率，KRAS激活突变可以超过该临界裂变率。【主编评语】

结直肠癌（CRC）被认为是当结肠隐窝内累积的突变负荷超过一定的阈值，导致克隆性扩张和最终的肿瘤转化时产生的。因此，定量研究正常上皮中体细胞突变的固定和随后的扩增是了解结直肠癌发生的关键。

Gastroenterology近期发表的文章，发现KDM6A的优势基因突变是通过隐窝分裂，而不是融合，显著扩增。隐窝扩散过程可以容纳新形成的隐窝达到一个阈值，超过这个阈值就可能导致息肉生长。

与KRAS突变相关的裂变率增加，或为KRAS引发息肉提供一个潜在的解释。（@爱的抉择）【原文信息】

A diffusion-like process accommodates new crypts during clonal expansion in human colonic epithelium

2021-04-22, doi: 10.1053/j.gastro.2021.04.035

Nature子刊：跨疾病的微生物组诊断指标或可实现！Nature Communications——[12.121] 从物种和基因水平分析100万多个微生物特征与13个队列的7个宿主表型之间的关联性； 冠状动脉疾病、炎症性肠病（IBD）和肝硬化具有链球菌属基因水平特征，

Nature Communications近期发表的文章，提出微生物组疾病“结构”，即用一个识别模型选择相关联的平台将100万多个微生物特征与13个队列的7个宿主表型联系起来，

通过量化微生物组疾病关联的保守性和异质性，并从基因水平的分析鉴定菌株特异性、交叉疾病、正向和负向的关联。研究或推动基于基因的跨疾病微生物组诊断。（@爱的抉择）【原文信息】

Gene-level metagenomic architectures across diseases yield high-resolution microbiome diagnostic indicators

2021-05-, doi: 10.1038/s41467-021-23029-8感谢本期日报的创作者：orchid，爱的抉择，祁玉丽，

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